A próxima edição da série Rainbow Six apresenta uma nova experiência para um jogador com equipamentos avançados e novas histórias. Desta vez, você pode jogar como Ding Chavez (o líder do Team Rainbow) ou Dieter Weber (um atirador encarregado de cobrir o movimento de sua equipe). Você deve liderar sua unidade antiterrorista em território desconhecido para combater uma ameaça bioterrorista. Rainbow Six 3 também apresenta modos multijogador online, incluindo o modo de rivalidade exclusivo para PS2 e o modo carreira exclusivo para Xbox.